第111期
2022 年 05 月 25 日
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CRISPR专利申请之争议(一)
叶云卿/台湾世新大学智慧财产研究所 副教授
张连成/台湾阳明交通大学药物科学院药学系 兼任助理教授

CRISPR-Cas9是一项划时代生物科技术,它是革命性的基因编辑方法,可用于修改生物体的基因组,以精确实现改变基因的理想,可允许删除现有基因和/或添加新基因。这项技术最早在1987 年,由一位日本科学家在大肠杆菌的基因体发现某一重复DNA(Repeat)小段,而这段序列后来被称为CRISPR(clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats,规则性间隔重复回文序列群)。
※本文为「CRISPR专利申请之争议」的第一部分,第二部分将于112期刊出


图片来源 : shutterstock、达志影像

此后,西班牙学者Mojica, F.发现可于P1噬菌体基因中找到特殊的的间隔序列(spacers),这种噬菌体容易感染大肠杆菌(E. coli),但是具有此间隔序列的大肠杆菌却不会被此噬菌体感染。2000年,研究人员已经发现20种不同微生物均有此重复序列(后称CRISPR),同时在此序列附近发现CAS基因(CRISPR associated genes)。2005年Mojica, F.发表研究成果,将CRISPR的间隔序列假设为一种细菌适应性的免疫系统(an adaptive immune system),同年一名法国学者Vergnaud, G.则认为CRISPR的间隔序列是细菌曾经对抗噬菌体的记忆。

2007年Horvath, P.等研究人员的研究指出Cas9与制造核酸酶有关。2010年Moineau等人的团队发现Cas9的运作需要crRNA的引导。2012年立陶宛的Vilnius大学学者Silksnys, V.及美国加州大学柏克莱分校的教授Daudna, J.将CRISPR系统复制于试管中[1]。2013年科学家张锋(Zhang, F.)在哺乳类细胞中用CRISPR系统做基因剪辑。2020年Daudna, J.教授与法国科学家Emmanuelle Marie Charpentier因开发CRISPR技术而获得诺贝尔化学奖[2]

CRISPR/Cas9为一种 RNA 带领 Cas9 nuclease 对目标基因 DNA 进行修饰的技术,简言之此项技术就像剪刀一样,在特定位置切割 DNA。然后科学家可以移除、添加或替换被切割的 DNA(作用机转如图1)。

图1. CRISPR/Cas9作用机转示意图

参考数据:The Heroes of CRISPR Cell. 2016 Jan 14;164(1-2):18-28.

此项技术相较于以往的基因修补技术(例如:ZFN & TALEN)而言,具备下列数项优点[3]:

  1. 没有物种限制、载体构筑简单快速
  2. Cas9辨识DNA效率高,标靶位点设计容易
  3. 毒性低、成功率高
  4. 费用较其他技术便宜

由于有上述优点,使得CRISPR/Cas9技术快速应用于哺乳类细胞中进行基因剪辑,科学家可以在小鼠的体内针对任何有兴趣的基因进行修饰,使生命科学以及基因工程的研究有了突破性的改变,更深入了解基因与健康和疾病的关联性,有助于发展新的治疗方法,将促使基因治疗、精准医疗等先进治疗方式蓬勃发展与应用,现阶段受限于载体与精准传输的限制,此项技术优先应用于体外基因编辑,其相关专利布局日趋重要,相继引起产官学界关注CRISPR专利申请之争议。

CRISPR 技术发展之重要事件[4]

根据 2020年IPSTUDY分析资料,全球CRISPR专利[5]有7427 个专利家族中,3078 个涉及治疗应用、996 个涉及动物改造、1232 个涉及植物改造和 541 个生物生产。全球已有 1850 多家机构和公司就其 CRISPR 研发提交了至少一专利申请,CRISPR技术的开发已然成型。

然而,对于CRISPR及其功能的发现是基于西班牙阿利坎特(University of Alicante)大学的Francisco Mojica的研究,他在1993年至2005年间进行CRISPR的基础研究[6]。Mojica 是第一位表征现在称为 CRISPR 基因座的研究人员,他与Ruud Jansen共同创造CRISPR此一名词。后来的研究人员发现细菌用以对抗病毒的 CRISPR/Cas9 系统可以作为简单、灵活的基因组编辑工具。2012年6月Emmanuelle Charpentier与任职于加州大学伯克利分校Jennifer Doudna联合发表一篇论文,充分解释了 Cas9 如何被引导至其目标,显示Cas9可以重新编程以选择任何目标DNA位点。几个月后,2013 年 1 月,任职于麻省理工学院和哈佛大学博德研究所的张锋,首次成功地将 CRISPR-Cas9 用于多细胞生物中的基因组编辑。

专利争议欧美命运大不同

Charpentier与Doudna在2020年也因为在CRISPR/Cas9 系统研究贡献而获得诺贝尔奖。然而,在专利战场上,由于加州大学与MIT大学前后申请CRISPR/Cas9的基础专利,导致二个专利产生谁是「先发明」的争议,更由于美国与欧洲法院对于法规有不同解释,导致同一团队研发的技术却因为申请程序的差异,而有不同的命运。

一、美国联邦法院对于「先发明」之判定

2017年PTAB认定加州大学所有的13/ 842,859专利[7]与MIT名下之 8,697,359专利,[8]二个专利权利并不冲突。PTAB审理结果,认为纵然认定加州大学859专利为先前技术,仍不影响359的进步性,二项专利可同时存在。针对PTAB的决定,而后加州大学至上诉联邦法院。2018年09月10日,美国联邦巡回上诉法院(CAFC)[9]维持2017年美国专利审理暨诉愿委员会(PTAB)决定,认为二个专利为不同发明[10]

PTAB审理过程中,比对加州大学与MIT双方的专利申请内容,发现双方的专利请求项记载其文字并不相同,但均包含 CRISPR-Cas9 系统和使用系统的方法,双方有争议的请求项,其技术特征与CRISPR-Cas9系统切断目标DNA分子之使用有关。请求项记载CRISPR-Cas9 系统,包含三个主要部分:(1)”crRNA” (2)“tracrRNA”(3)Cas-9 protein。

主要比对的请求项为,加州大学859号专利第165项请求项,与MIT所申请的359专利请求项第一项,整理如下。前者,请求项之记载,并未限缩使用于原核细胞:­「A method of cleaving a nucleic acid comprising contacting a target DNA molecule having a target sequence」,因此产生第165项的技术内容是否可扩及真核细胞之运用之争议。而后者,则记载在真核细胞使用:「A method of altering expression of at least one gene product comprising introducing into a eukaryotic cell …」。因此,后者该运用特别限缩于真核细胞之运用。

859专利 claim 165

359专利 claim 1

A method of cleaving a nucleic acid comprising
contacting a target DNA molecule having a target sequence with an engineered and/or non-naturally-occurring Type II Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)--CRISPR associated (Cas) (CRISPR-Cas) system comprising
a) a Cas9 protein; and
b) a single molecule DNA-targeting RNA comprising
i) a targeter-RNA that hybridizes with the target sequence, and
ii) an activator-RNA that hybridizes with the targeter-RNA to form a double-stranded RNA duplex of a protein-binding segment,
wherein the activator-RNA and the targeter-RNA are covalently linked to one another with intervening nucleotides,
wherein the single molecule DNA-targeting RNA forms a complex with the Cas9 protein, whereby the single molecule DNA-targeting RNA targets the target sequence, and the Cas9 protein cleaves the target DNA molecule

A method of altering expression of at least one gene product comprising introducing into a eukaryotic cell containing and expressing a DNA molecule having a target sequence and encoding the gene product an engineered, non-naturally occurring Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)--CRISPR associated (Cas) (CRISPR-Cas) system comprising one or more vectors comprising:
a) a first regulatory element operable in a eukaryotic cell operably linked to at least one nucleotide sequence encoding a CRISPR-Cas system guide RNA that hybridizes with the target sequence, and
b) a second regulatory element operable in a eukaryotic cell operably linked to a nucleotide sequence encoding a Type-II Cas9 protein, wherein components (a) and (b) are located on same or different vectors of the system, whereby the guide RNA targets the target sequence and the Cas9 protein cleaves the DNA molecule, whereby expression of the at least one gene product is altered; and, wherein the Cas9 protein and the guide RNA do not naturally occur together.

2017年PTAB的决定,认为上述二个专利并不冲突。加州大学对此结果上诉。上诉法院审理主要争点为:PTAB所审酌MIT所提供证据,是否支持加州大学的发明可以在真核细胞实现这件事,欠缺合理期待性?上诉法院依据原来PTAB所审酌证据,认定MIT已经提供实质证据证明,该领域技艺之人由加州大学859专利,无合理期待该专利可以在真核细胞实现。因此该项技术对于359专利并不显著。

 

备注:

 

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【本文只反映专家作者意见,不代表本报立场。】

作者: 叶云卿
现任: 北美智权(cn.naipo.com)外稿作家
台湾世新大学 知识产权研究所 副教授
台湾科技大学 专利所 兼任助理教授
学历: 美国旧金山金门大学 法律博士(SJD)
美国华盛顿大学 法律硕士(LLM)
台湾政治大学 法律硕士
台湾大学环境工程所 工程硕士
经历: 台湾科技大学专利所 助理教授
美国旧金山 Suzan See Law Office法务
美国硅谷 Vivian Lu Law Office法务
台湾建业律师联合事务所律师
台湾环宇律师事务所律师
产学合作计划: 美国诉讼管理产学合作计划
代表著作: 营业秘密刑事责任
中小企业知识产权管理制度建置
专利意见书在诉讼上之运用
證照: 律师、台湾专利代理人、环境工程技师、仲裁人、ISO14000管理师

作者: 张连成
现任: 台湾阳明交通大学药物科学院药学系 兼任助理教授
学历: 台湾阳明大学生物药学所博士
经历: TFDA 技正、副研究员、科长

 


 





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